Hello, :-)

если нужен ять без "хачика", то его можно взять из другого шрифта. Существует множество свободных и не очень ttf-шрифтов, где есть почти все знаки церковнославянской письменности, например, большое семейство шрифтов DejaVu, шрифт FreeSerif, семейство шрифтов Lucida, болгарский шрифт Menanion и многие др.
Один из самых простых (2-5 мин.) способов для подключения любого ttf, Type 1 и некоторых др. типов шрифтов к pdfLaTeX в использовании экспериментальной программы AFMtoENC, которую можно взять с сайта
http://litwr.boom.ru/tex-en.html
Вместе с ней распространяется сценарий для быстрой установки шрифта и инструкция. Пока поддерживаются только кодировки OT1, T1, T2A, T2B, T2C, T2D, T5, LAE, LFE. К сожалению, более 20 глиф T2D (буквы, диакритические знаки) до сих пор не представлены в Unicode, вследствии чего они отсутствуют в ttf-шрифтах. :-(

with kind regard
  Vladimir Lidovski

p.s. Should I translate this to English?