У меня симптомы несколько другие (вообще ни одно начертание не
загружается, кроме регулярного), но проблема имеет место быть.
Причем похоже, что она возникает на уровне fontconfig и, соответственно,
средствами XeTeX или fontspec не решается. Дело в том, что у старых
шрифтов от Paratype довольно своеобразная номенклатура: в поле FullName
название кодировки идет после начертания (напр.
"PT Newton Italic Cyrillic"). Вот это, видимо, и сбивает с толку
fontconfig: он видит четыре начертания, но считает их все регулярными.

Боюсь, что лечится это только правкой шрифтов.