> Можно ли отследить, более ли менее автоматически, на все ли
> нумерованные формулы (в том числе и многострочные) есть хотя бы одна
> ссылка в дальнейшем тексте (\ref, \eqref и т.д.)?
>
> Может пакет какой-то? А то иначе придется скрипт писать...

\usepackage{refcheck}

--
С уважением,
Денис Рябов