Semenov Mike Friday, January 15, 2010, 13:29:55:

SM> Прикладываю к ответу test.zip (33 КБ).

Там скрипт очень капризный и много чего не
понимает. Надо с ним экспериментировать
по-разному. Можно каждый файл, включаемый как
include, импортировать отдельно, обрамив
\documentclass{book}
\usepackage[cp1251]{inputenc}
\usepackage[russian]{babel}
\begin{document}
и
\end{document}
(У меня это с вашим документом прошло.)
Потом создать головной документ и вставить уже
туда созданные файлы.

Ну и для того чтобы dvi получить, придется,
наверное, еще "напильником работать".

Только вот для класса disser пока в LyX не сделали
прилад. Соответствующий layout придется писать
самому. Я для упоминавшейся книги пользовался
стандартным классом memoir.